Объявления: 877-459-0909
Реклама: 877-702-0220  
Вход Регистрация
Раскрыть 
 

ДНК детективы ищут следы вирусов

04/14/2014 7 Дней
DNA_virus

Возможно, вы уже слышали про генное картирование, проводимое для диагностирования редких заболеваний, предсказаний заболевания раком и составления родословной. Но знали ли вы, что с его помощью можно выявлять пищевые отравления?

Американские ДНК детективу начинают программу в попытке предвосхитить вспышки эпидемий, в рабочем порядке расшифровывая ДНК потенциально смертельных бактерий и вирусов.

Первоначальной целью стала листерия, одна из трех самых распространенных причин смерти от пищевого отравления. Эти бактерии особенно опасны для беременных женщин. Уже сейчас правительство признает, что технология помогла положить конец вспышке эпидемии листерии, во время которой один человек погиб в Калифорнии и еще 7 заболели в Мэриленде.

«Это на самом деле новый способ обнаружения и борьбы с инфекциями, - сказал доктор Том Фриден, директор Центра по контролю за заболеваниями и профилактике. – Можно даже задаться вопросом, определяет ли он подозреваемого в ходе визуального опознания или по отпечаткам пальцев?»

Полная геномная последовательность, или картирование всей последовательности ДНК организма, стала главным элементом медицинских исследований. Но в области общественного здравоохранения ее используют более выборочно для определения особенно опасных очагов или возникающих патогенов, таких как новый штамм птичьего гриппа.

При повседневном определении очагов заражения официальные лица полагаются на применяемые десятилетиями тесты, в ходе которых используются только части ДНК.

Теперь, когда геномная последовательность становится быстрее и дешевле, CDC получил $30 млн от Конгресса на расширение использования этого метода в программе, получившей название продвинутое молекулярное обнаружение. Медики надеются, что теперь они смогут быстрее ликвидировать очаги заражения (как распространяемые через пищевой тракт, так и другие), и, возможно, также предупреждать инфекционные заболевания, лучше поняв, как они распространяются.

«Честно говоря, в области общественного здравоохранения нам необходимо наверстать упущенное», - сказал доктор Кристофер Брейден из CDC, один из руководителей проекта.

Впервые эта технология используется для наблюдения за обычными заболеваниями, выявляя пациентов со схожими штаммами, которые могли заразиться от одного источника.

Если пилотный проект окажется удачным, в CDC считают, что он подготовит почву для полного пересмотра работы санитарно-гигиенических лабораторий, занимающихся вопросом безопасности продуктов питания, и позволит использовать эту технологию при работе с эпидемиями других видов.

«Геномная последовательность – это на самом деле совершенный метод снятия ДНК отпечатков», - говорит Лэнс Прайс, микробиолог из университета Джорджа Вашингтона, использующий этот метод для изучения распространения устойчивых к антибиотикам бактерий. Он также считает, что действия CDC сильно запоздали.

Особенно в случаях болезней, распространяющихся через пищеварительный тракт, данная технология повысит возможности исследователей определить ответственную за начало заболевания бактерию. И чем быстрее это произойдет, тем меньше человек заболеет.

«Это изменить все, вплоть до установления источника, - добавил Прайс. – Отзывы продукции стоят очень дорого, компании их не любят», и они должны быть точными.

Сегодняшние стандартные тесты иногда упускают взаимосвязь между больными или выводят на ложный след. Например, американские официальные лица в 2012 году изначально считали, что эпидемия сальмонеллы в Нидерландах, связанная с копченым лососем, имела какую-то связь с местными больными. Проведенная позже геномная последовательность показала, что возбудители были разными.

«Нынешний способ субтипирования сальмонеллы не так уж и хорош», - считает эпидемиолог Дэвид Боксруд из департамента здравоохранения Миннесоты, который является частью сети Управления по контролю за продуктами и лекарствами, начавшего устанавливать ДНК последовательность этой бактерии и определять другие по мере их обнаружения в пище. В эту сеть входят также лаборатории в Аризоне, Флориде, Мэриленде, Нью-Йорке, Вирджинии и Вашингтоне.

Установление геномной последовательности может помочь выявить устойчивость к лекарственным средствам и степень вирулентности микроба быстрее, чем сегодняшние тесты. Оно также помогает установить способ распространения вируса при помощи мелких генетических изменений, которые можно назвать следами.

Ключевым элементом, позволяющим установить «злоумышленника», является вычислительная способность огромной федеральной базы данных, в которой хранятся генные карты. Одно дело проанализировать ДНК бактерий, собранное у нескольких десятков пациентов во время эпидемии, и совсем другое – сравнить образцы, собранные у нескольких тысяч.

 
 

Похожие новости


Газета «7 Дней» выходит в Чикаго с 1995 года. Русские в Америке, мнение американцев о России, взгляд на Россию из-за рубежа — основные темы издания. Старейшее русскоязычное СМИ в Чикаго. «7 Дней» это политические обзоры, колонки аналитиков и удобный сервис для тех, кто ищет работу в Чикаго или заработки в США. Американцы о России по-русски!

Подписка на рассылку

Получать новости на почту